Para solucionar este problema, decidí crear una función de xsl, mas que una función es un template, pero como a mi me gusta usar los templates como funciones con parámetros, también me gusta llamarlas funciones. Bueno, el caso es que he creado una función/template, que recibe 3 parámetros, y que vendría a ser mas o menos como el replace de php, pero con el funcionamiento del replace de javascript, porque de momento solo reemplaza de 1 en 1, digamos que no es un replace all. La función recibe 3 parámetros, uno con el texto a base, la cadena de donde queremos reemplazar el texto, otro parámetro con el texto que va a ser reemplazado, y otro parámetro con el texto a reemplazar. El código de la función seria el siguiente:

<!-- Funcion replace -->
<xsl:template name="replace">
   <!-- Cadena de texto -->
   <xsl:param name="text" />
   <!-- Texto que va a ser reemplazado -->
   <xsl:param name="replaceText" />
   <!-- Texto a reemplazar -->
   <xsl:param name="replacedText" />
 
   <!-- El replace propiamente dicho -->
   <xsl:value-of select="substring-before($text,$replaceText)" />
   <xsl:value-of select="$replacedText" />
   <xsl:value-of select="substring-after($text,$replaceText)" />
</xsl:template>
 
<!-- Ejemplo de utilizacion -->
<xsl:variable name="price">
   <xsl:call-template name="replace">
      <xsl:with-param name="text" select="$xml/POSIBILIDADES_PRECIO-IDA" />
      <xsl:with-param name="replaceText" select="','" />
      <xsl:with-param name="replacedText" select="'.'" />
   </xsl:call-template>
</xsl:variable>

Espero que esta pequeña función para xsl, os sea tan útil como a mi. Por cierto, el ejemplo me lo saque de uno que monte en el curro, así que cada uno lo tendrá que modificar en base a sus necesidades. A ver si me lo curro un poco y modifico la función para que sea un replace all, en lugar de un replace one.